武科大网讯(通讯员曾宪森 张炎)近日,计算机科学与技术学院林晓丽博士团队的研究成果PAMol: Pocket-Aware Drug Design Method with Hypergraph Representation of Protein Pocket Structure and Feature Fusion被第34届国际人工智能联合会议(IJCAI2025)录用,林晓丽博士为文章第一作者,硕士研究生廖雄威为第二作者。
该论文利用AI技术有效地生成靶向药物分子在药物发现领域具有重要意义,它通过智能算法和大数据分析加速了分子设计流程,显著提高了药物研发的效率与精准性,为解决复杂疾病治疗难题提供了新路径。该论文提出一种基于蛋白质口袋超图表示以及多模态特征融合的靶向药物分子生成方法(PAMol),其充分利用蛋白质口袋的高阶结构信息,融合蛋白质的序列、结构,以及分子的序列、理化信息,设计一种口袋约束的分子生成器,从而生成高质量的靶向药物分子。
在胰腺癌的两个重要治疗靶点KRAS (UniProt ID: P01116, PDB ID: 8onv) 和 EGFR (UniProt ID: P00533, PDB ID: 8a27)上进行了案例研究,结果表明,生成的分子与靶点有较高的结合亲和力,且在关键指标上表现优异。

据悉,IJCAI会议内容主要围绕人工智能相关理论及应用,是人工智能领域中最主要的学术会议之一,也是全球学术界以及企业界人工智能研究人员和实践者的顶级国际聚会。中国计算机学会(CCF)推荐国际学术会议目录将IJCAI列为人工智能领域A类会议。本届IJCAI会议共有5404篇投稿(主会),经过全面而严格的审查程序,仅有1042篇论文脱颖而出,录取率19.3%。